研究报告/Research Report

利用荧光 SSR 标记构建含笑种质指纹图谱  

郑纪伟 , 教忠意 , 窦全琴 , 黄利斌 , 何旭东*
江苏省林业科学研究院, 南京, 211153
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2017年11月22日    接受日期: 2017年12月11日    发表日期: 2018年08月08日
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推荐引用:

引用格式:Zheng J.W., Jiao Z.Y., Dou Q.Q., Huang L.B., and He X.D., 2018, Construction of fingerprint of Michelia germplasm by fluorescent SSR markers, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4705-4714 (郑纪伟, 教忠意, 窦全琴, 黄利斌, 何旭东, 2018, 利用荧光 SSR 标记构建含笑种质指纹图谱, 分子植物育种, 16(14): 4705-4714)

摘要

本研究基于高通量荧光 SSR 标记基因分型技术构建了 16 份含笑种质的指纹图谱。13 对来自近缘种的 SSR 标记共检测到 102 条等位片段,每个位点等位基因数 5~11 不等,平均为 7.8 个。观测杂合度(Ho)变化范围为 0.125 0~0.562 5,平均为 0.365 0;期望杂合度(He)变化范围为0.6703~0.911 3,平均为 0.809 9;多态信息量(PIC)变化范围为 0.574 8~0.871 4,平均为 0.751 5。优选的 4对核心引物中,LT106 SGA5 组合、LT106LT58 组合以及 SGA5 MMA51 组合可完全区分 16 份含笑种质。聚类结果显示 16 份含笑种质遗传相似系数在 0.70~0.90 之间,同一种内的不同个体均能很好的聚在一起。本研究建立的荧光 SSR 基因分型体系高效、快速、准确,不但能为含笑属种质鉴定及新品种保护提供科学理论依据,同时也能为含笑进一步育种工作奠定坚实的基础。

关键词
含笑;荧光标记;SSR;指纹图谱

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《分子植物育种》印刷版
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